É muito importante que a medição e monitoramento do seqüestro de carbono  no Projeto de Ação Climática Guaraqueçaba sejam feitos de forma precisa e confiável. O monitoramento e verificação dos benefícios do carbono do projeto deverão quantificar, com alto grau de precisão, a porção de carbono existente na área previamente ao início do projeto e quanto carbono é capturado ou quantas emissões são evitadas como resultado do mesmo.  Os dados sobre o carbono deverão ser obtidos através de técnicas florestais comprovadas para a medição do carbono na vegetação acima do solo, raízes, liteiras das folhas, assim como nos solos em 188 parcelas permanentes demarcadas na área de preservação. Estas informações serão estatisticamente aplicáveis a toda a área do projeto. 

O programa de monitoramento e verificação foi desenvolvido com a assessoria de uma das maiores experts do mundo nesta área, a Winrock International, utilizando uma metodologia que fornecerá o grau desejado de exatidão. Os técnicos do projeto têm utilizado também um APainel para Consulta Técnica@ para verificar a validade, precisão e abrangência dos procedimentos de monitoramento de carbono empregados para medir o seqüestro de carbono no projeto. Cada tonelada de carbono resultante da anulação, redução ou abrandamento das emissões do gás atribuída ao projeto é designada como um crédito potencial de equivalência de emissão de carbono para a AEP e o patrocínio do projeto. Veja Créditos de Equivalência de Emissão de Carbono.